在有机肥发酵过程中，需要将原料撒上，使中间材料与空气充分接触，进行发酵、分解和除水。由于有机原料在大规模生产中处理量大，人工操作是不现实的，需要使用有机肥发酵堆垛机设备。
槽式发酵堆垛机是生产有机肥料的实用翻转机械设备。它由两个固定导轨组成，允许翻叠机来回行走进行翻转操作。适用于鸡、牛、羊、猪等畜禽新鲜粪便、污水处理厂污泥、城市固体废物肥料土壤修复和微生物发酵生产工艺要求。能有效混合畜禽粪便、污泥、微生物制剂和秸秆辅料，为有机肥原料发酵创造更好的有氧环境。
一天加热，两天消毒（可杀死粪便中的病毒），三天干燥，7-15天成为肥料。它不仅比使用其他机械设备更快，而且更有效。还能有效防止硫化氢、胺等有害恶臭气体的发酵，不仅满足环保要求，而且生产大量优质生物有机肥。
有机肥原料发酵后，如果不能判断分解是否完成，有一个简单的小方法：取一公斤有机肥，放入密封塑料袋中，绑紧，在室温下放置24小时以上。如果塑料袋没有膨胀，这意味着有机肥已经完全分解。
